Как ответить на уведомление из ИФНС о выплате доходов иностранным организациям, если не был отражен экспорт?

Добрый день!

Получили уведомление из ИФНС, в котором говорится о том, что имеются суммы выплаченные иностранным организациям доходов за 2016 год. Ничего не понимая, созваниваюсь с инспектором. Инспектор ссылается на Москву, "как они прислали, мы так и отправили", но удалось выяснить 2 суммы, которые Москва указаны в требовании к нашей налоговой инспекции, а так же, что эти данные получены из Таможни.
Созваниваюсь с нашим брокером, который нам оформляет все Декларации на товары. Выясняется, что в апреле 2016 года, был в Узбекистан отправлен товар для испытаний (медицинский инструмент), декларация оформлена на временный вывоз (полгода), указана нулевая стоимость. У бывшего главного бухгалтера это нигде и никак не отражено. Далее выясняется, что временно вывезенный товар не возвращался, а оформлена через полгода еще одна декларация, уже на реализацию, где указана стоимость. Указанная стоимость как раз и является одной из цифр, озвученных налоговым инспектором, вторую цифру вместе с руководителем так и не можем выяснить.

Ситуация произошла так: менеджер не оформил документально отгрузку в Узбекистан (причем ни в первый раз, когда отправлял товар на испытания, ни второй-когда уже переоформил ГТД как на реализацию), соответственно бухгалтерия об этом не знала, товар не оплачен до настоящего времени. 
На данный момент налоговая инспекция не расценивает эту операцию как экспорт, на основании Уведомления эти цифры значатся как прочая внешнеторговая деятельность, ответить на уведомление нужно, а я не знаю с какой стороны взяться за все это. 

Получается, сейчас нужно исправить декларацию по налогу на прибыль за 2016 год, она за собой потянет отчет по НДС (а он у нас льготный). Так же валютный контроль банка почему-то не задали вопросов намного раньше, у них же идет обмен с таможенной службой, а оплаты за экспортный товар не поступало. Может оформить это как внешнеторговую и заполнить форму налогового расчета, утвержденную приказом ФНС России от 02.03.2016 № ММВ-7-3/115@, опять же это просто мои мысли, возможно это противоречит закону. И вторая цифра, названная инспектором так и не выяснена и выяснена не будет скорее всего. 
Посоветуйте, многоуважаемые форумчане, может кто сталкивался с такой ситуацией, как уладить такую не очень приятную ситуацию с меньшими потерями и грамотно? Заранее спасибо!